Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brms1Q99N20 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms