Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms