Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Dnaja3Q99M87 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms