Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms