Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lactb2Q99KR3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms