Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms