Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Hps4Q99KG7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Hps4Q99KG7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Hps4Q99KG7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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Hps4Q99KG7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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