Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms