Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms