Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

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Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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