Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms