Protein–RNA interactions for Protein: Q91V98

Cd248, Endosialin, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cd248Q91V98 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cd248Q91V98 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cd248Q91V98 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cd248Q91V98 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cd248Q91V98 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cd248Q91V98 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cd248Q91V98 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd248Q91V98 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms