Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Sgms1Q8VCQ6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms1Q8VCQ6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms1Q8VCQ6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms1Q8VCQ6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms1Q8VCQ6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms1Q8VCQ6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms1Q8VCQ6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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