Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms