Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms