Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A2

Trpt1, tRNA 2'-phosphotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpt1Q8K3A2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Trpt1Q8K3A2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Trpt1Q8K3A2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Trpt1Q8K3A2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Trpt1Q8K3A2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trpt1Q8K3A2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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