Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Abcf3Q8K268 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms