Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Trim68Q8K243 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Trim68Q8K243 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Trim68Q8K243 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Trim68Q8K243 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Trim68Q8K243 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Trim68Q8K243 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Trim68Q8K243 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Trim68Q8K243 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Trim68Q8K243 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Trim68Q8K243 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Trim68Q8K243 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Trim68Q8K243 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Trim68Q8K243 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Trim68Q8K243 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trim68Q8K243 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trim68Q8K243 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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