Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms