Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms