Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ19

Mical3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, mousemouse

Predictions only

Length 1,993 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mical3Q8CJ19 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mical3Q8CJ19 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms