Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TwnkQ8CIW5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TwnkQ8CIW5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms