Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Upp2Q8CGR7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms