Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hpf1Q8CFE2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hpf1Q8CFE2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hpf1Q8CFE2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hpf1Q8CFE2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hpf1Q8CFE2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hpf1Q8CFE2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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Hpf1Q8CFE2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Hpf1Q8CFE2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Hpf1Q8CFE2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Hpf1Q8CFE2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Hpf1Q8CFE2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Hpf1Q8CFE2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Hpf1Q8CFE2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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