Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc38Q8CDN8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc38Q8CDN8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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