Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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