Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fbxo48Q8CAT8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms