Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms