Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms