Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.5 ms