Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube3dQ8BX13 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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