Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms