Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BGC1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms