Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Htatsf1Q8BGC0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Htatsf1Q8BGC0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htatsf1Q8BGC0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htatsf1Q8BGC0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htatsf1Q8BGC0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htatsf1Q8BGC0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Htatsf1Q8BGC0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htatsf1Q8BGC0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htatsf1Q8BGC0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htatsf1Q8BGC0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Htatsf1Q8BGC0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Htatsf1Q8BGC0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Htatsf1Q8BGC0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Htatsf1Q8BGC0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htatsf1Q8BGC0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htatsf1Q8BGC0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htatsf1Q8BGC0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htatsf1Q8BGC0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Htatsf1Q8BGC0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Htatsf1Q8BGC0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Htatsf1Q8BGC0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Htatsf1Q8BGC0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Htatsf1Q8BGC0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms