Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms