Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms