Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms