Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ttc28Q80XJ3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ttc28Q80XJ3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ttc28Q80XJ3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ttc28Q80XJ3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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