Protein–RNA interactions for Protein: Q80W14

Prpf40b, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf40bQ80W14 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Prpf40bQ80W14 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Prpf40bQ80W14 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Prpf40bQ80W14 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Prpf40bQ80W14 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Prpf40bQ80W14 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Prpf40bQ80W14 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Prpf40bQ80W14 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Prpf40bQ80W14 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Prpf40bQ80W14 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Prpf40bQ80W14 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf40bQ80W14 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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