Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ScocQ78YZ6 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms