Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trappc6aQ78XR0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trappc6aQ78XR0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trappc6aQ78XR0 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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