Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim12Q78RX3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms