Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GypcQ78HU7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms