Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnih3Q6ZWS4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnih3Q6ZWS4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnih3Q6ZWS4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnih3Q6ZWS4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnih3Q6ZWS4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnih3Q6ZWS4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnih3Q6ZWS4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnih3Q6ZWS4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnih3Q6ZWS4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnih3Q6ZWS4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnih3Q6ZWS4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnih3Q6ZWS4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnih3Q6ZWS4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnih3Q6ZWS4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnih3Q6ZWS4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnih3Q6ZWS4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnih3Q6ZWS4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnih3Q6ZWS4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnih3Q6ZWS4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cnih3Q6ZWS4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cnih3Q6ZWS4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnih3Q6ZWS4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms