Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ccdc88cQ6VGS5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ccdc88cQ6VGS5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ccdc88cQ6VGS5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ccdc88cQ6VGS5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ccdc88cQ6VGS5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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