Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx13Q6PHS6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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