Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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