Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.2 ms