Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Krt39Q6IFX4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Krt39Q6IFX4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Krt39Q6IFX4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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