Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rftn1Q6A0D4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rftn1Q6A0D4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rftn1Q6A0D4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rftn1Q6A0D4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rftn1Q6A0D4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rftn1Q6A0D4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rftn1Q6A0D4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rftn1Q6A0D4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rftn1Q6A0D4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rftn1Q6A0D4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rftn1Q6A0D4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rftn1Q6A0D4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rftn1Q6A0D4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rftn1Q6A0D4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rftn1Q6A0D4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rftn1Q6A0D4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rftn1Q6A0D4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms